大學院相當於中國大學的研究生院，壹般不是行政機構，是教學單位，依附於學部（相當於中國大學的學院），也有單獨開設的（學部階段沒有課程）。
研究科相當於中國大學具體的研究生院，比如日本大學的工學研究科，相當於中國大學工學研究生院。
因此，實際上大學院和研究科是壹體的，日本壹般稱為某某大學大學院某某研究科，而中國大學壹般沒有此類稱呼。
專攻：就是專業。這個各個大學之間還是有差距的。大部分相當於國內大學的二級學科；少部分相當於三級學科；還有的就是壹級學科。大部分情況下是相當於國內大學研究生教育的專業的。妳的理解是對的。
學部相當於中國大學開展本專科教育的學院或者獨立系（不是二級學院裏面的）。比如工學部相當於中國大學的工學院。妳的理解也是對的。
course和講座壹般是指課程，但是，在部分日本大學，是相當於專攻的，這個因校而異。
學科：我們所說的專業。比如醫學科，就相當於我們大學的醫學專業。大部分是相當於國內大學的本專科階段的專業的。
學科目：應該是指課程，具體的比如數學、專業課程、英語等。
研究所或者什麽研究中心、研究室，壹般是指依附或者不依附於學部的研究機構，有的研究機構具有學部生、修士博士課程教育功能，可以招生培養的。中國大學也有此類機構，壹般是單獨設置的，和各個學院的研究生教育是壹個級別的，比如北京大學網絡與信息系統研究所，既有本科教育也有研究生教育。有的研究所是在學部或研究科內部的，不單獨招生但是單獨培養---就是研究科統壹招進來，他們研究所單獨培養。
大學院研究科課程對於申請者在大學期間的gpa、課程成績以及實踐經驗的要求，因大學而異，同時也因導師而異。部分大學尤其是名校的研究科和導師，還是對gpa很在意的，但是大部分不在意，別太差即可。關於社會工作經驗的問題，部分專攻是有明確要求的，包括經濟學經營學等方向的專攻。這個因校而異。
關於經濟學和經營學以及商學等的募集要求，這個要看大學的要求，和妳學文理關系不大。如果是考大學院，那麽專業對口即可。如果是考大學學部，那麽根據要求遞交日本留學試驗的科目成績和參加大學入學考試即可。同樣，要求也是壹句廢話---因校而異。
關於經濟學科等課程設置，到各個大學網站去看吧，沒辦法，還是那句廢話---因校而異。
日本大學的教育制度和教學管理，和中國大學差不多，只不過由於使用了漢字，所以有很多我們理解起來有些困惑的地方。慢慢了解吧。
日倭駐華大使館網站有詳細的留學說明，看完妳會成為專家的。